Creo que no eres un experto en la materia, (no me judgues, yo tampoco).

Para Jugar juegos de Nintendo DS:

1. Vete a configuración de la consola.

2. En la patalla superios, en la esquina inferior derecha veras su "FIRMWARE" (La versión)

3. Busca una flashcard de Nintendo DS por internet que sea compatible con ese firmware (Seguro que te funciona una llamada DSTwo)

4. Cuando la tengas descargaté juegos en formato .nds (quiere decir que todos los nombres deben acabar en ".nds".

5. Usando un USB que viene con la mayoría de las tarjetas, introduce tu MicroSD (Recomiendo 4 o 8 GB para no tener problemas) en el USB, a su vez, este, en el ordenador y copia y pega en la MicroSD (No borres ninguna carpeta que posiblemente halla en la MicroSD) 

6. Extrae el USB, a su vez, la MicroSD y coloca la MicroSD (bien colocada) en la ranura que trae la Flashcard (el cartuchito para flashear).

7.Introduce la Flashcard en la Nintendo 3DS (Me rimbombea eso de "DS 3D") 

8. Espera que se cargue, dale al juego (o Homebrew) que desees ejecutar y a disfrutar.

Para juegos de Nintendo 3DS:

Actualmente hay una forma temprana, es comprando una flashcard llamada Gateway 3DS (cabe destacar que por 65€ trae una flashcard de Nintendo DS y una de Nintendo 3DS)

Te recomiendo que esperes unos meses a comprarte una flashcard que sea compatible con los juegos de Nintendo 3DS.

PD: Tienes que conseguir los archivos que encontrarás en la página oficial de la flashcard e introducirlos en la MicroSD.

Si necesitas más ayuda pregunta.