A consejo que hagas un backup del kernel de tu 3ds y lo guardes a buen recambio, y si por despiste o por lo que sea le has dado aceptar y se crasea la consola solo tendrias que volver a menterselo

No hay forma directa de borrar la actualizacion descargada por la consola, en la red no existe información y dudo que en futuro proximo se haye pues es una consola ya denominada retro y no se habla abiertamente de ella y si tratas de hacerlo en EOL te cierran el tema o te banean 

Eso es todo

Antes de cada arranque lean atentamente la ventana que te salga antes de darle a cualquier boton prevenir antes que curar.