alomejor no ace falta formatear a mi me pasava con el fifa 09 pero cuando puse los menus v1.15 ya me iva asi q puede ser que tengas una version antigua d los menus aqui t puedes descargar las nuevas versiones http://www.ndstt.com/en/download.html 

tambien esta en la seccion de flash cart en ttds

formatear es simplemente borar todo pero como sabeis ahi archibos ocultos y de sistema que no se ben y pues no los puedes borara(si se pueden pero hay que saber como) ahora formatear propiamente dicho se hace asi desde mipc boton derecho del mouse ensima de tu memoria y aparesera un desplegado seleccionas formatear y aparesera una ventana y en sistema de archivos seleccionas fat32 y la casilla formato rapido luego click en iniciar y te pregunta si estas segur@ dises si y la formateara ahora solo pon todo de nuebo y listo a nota si usas homebrew espero que si cuando este la memoria limpia primero pon los juegos que quieres arrancalos ya que agarren ya puedes poner homebrew(programas caseros) nota le y haz lo que dise mi firma primero lo de abajo de la imagen