Es cierto lo que dice AurosZXMM, tienes que ponerlo en la carpeta data del arm9, aunque yo prefriria un filesystem, si no tu video tiene que ser menos de 4MB de la DS...

Aunque lo que molaria es algun codec que compilara con las ultimas libnds, y poder usarlo en el Homebrew, pero si no aparece ninguno...

AÑADO: Para hacer eso yo lo primero que haria seria reorganizar el proyecto ese de los swf, cojeria las carpetas esas de libjpg, libz, libpng y demas y las compilaria a una libreria sola (un .a y sus .h), entonces cojeria la plantilla combinada de libnds, coje este Makefile unico, añadiendo la ruta de las librerias, despues haces la carpeta nitrofiles y pones tu SWF, luego pones los codigos que ponen en las carpetas arm7 y arm9 y los pegas en la carpeta source de ese proyecto, inicias nitroFS en el archivo principal, et violá, tu video en SWF, sin limites de tamaño y sin lios de arm9 y arm7 xD

Esto puede serte demasiado lioso si no has programado en tu vida xD, si no entiendes te lo explico mejor por privado xDD.

A cambio de todo esto necesito que respondais a una pregunta... los videos en SWF, cuanto ocupan, con respecto a la duracion? P.E: Cuanto ocuparia un SWF que dura 2 minutos?

Gracias

pues esto se podría hacer librería para aprovecharlo como un "codec" de video... para compilarlo debes fijarte en que esta hecho primero: libnds, Palib, NFlib, etc (probablemente sea libnds, que tiene más funciones...)... Aunque ahora que reviso, está hecho directamente con el devkitpro, y se incluyen librerías creadas por el autor para la reproducción del swf... interesante...

Si quieres usar tu propia animación, parece quedebes renombrarla (con todo y entensión) a swf.bin, y lo metes en la carpeta arm9/data. Para compilarlo debes tener instalado el devkitpro... sobre como compilar directamente desde ahí, no se. Esperemos a ver si kNightFox pasa por aquí o alguien que sepa del tema...