Pues no soy un experto pero sin irnos muy lejos te recomiendo lo siguiente:

-Baja de aquí el YSMenu v6.43

-Baja las librerías actuales v6.53

-No se que ROMs de Pokemon B/W estés usando, pero en la red están las versiones Europeas en Inglés parcheadas, esas funcionan perfecto con las librerías 6.53, si tus ROMs son en el mismo idioma puedes usar tu SAV sin problemas, de lo contrario considera el reiniciar tu partida.

-Igualmente debes de buscar las versiones HG/SS parcheadas, a estas alturas no debe ser difícil encontrarlas, realmente cuando fallan los juegos así como dices yo prefiero irme a la segura y buscar un sitio donde actualicen seguido con parches y todo.

Suerte.